Ob koncu davčnega obdobja lahko nastanejo zamudne obresti v vseh primerih, ko je bil DDV v preteklih davčnih obdobjih obračunan napačno, ne glede na to, ali gre za dodatno obveznost ali za popravek odbitka DDV.

Najpogostejša primera sta:

• Prepozen obračun izstopnega DDV (npr. račun je izdan po zaključku davčnega obdobja, čeprav bi moral biti izdan prej). V tem primeru je bil DDV obračunan prepozno, zato se obračunajo zamudne obresti.
• Prejet dobropis, pri katerem je prikazan negativen znesek DDV. Čeprav je znesek DDV na dobropisu negativen, to ne pomeni, da zamudnih obresti ni treba obračunati. Dobropis namreč pomeni, da je bil v preteklem obdobju DDV odbit prezgodaj ali v previsokem znesku. Ker zavezanec do takšnega odbitka v tistem obdobju ni bil upravičen, je treba za znesek preveč odbitega DDV obračunati tudi zamudne obresti.

Pri presoji zato ni odločilen predznak DDV na dokumentu ali v obračunu DDV, temveč dejstvo, da se z dokumentom popravlja nepravilno obračunan ali odbit DDV v preteklem davčnem obdobju. V takih primerih je treba za neustrezno obračunan ali odbit znesek DDV obračunati zamudne obresti, ne glede na predznak, ki je izpisan na dokumentu.